农业环境科学学报

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:12-1347/S

国际刊号:1672-2043

农业环境科学学报杂志2021年第8期:基于eDNA技术的白洋淀微型生物群落监测

发布日期:

作者:陈家琪,董丽,麻晓梅,田凯,白洁,赵彦伟

单位:北京师范大学环境学院, 水环境模拟国家重点实验室, 北京 100875,北京师范大学环境学院, 水环境模拟国家重点实验室, 北京 100875,北京师范大学环境学院, 水环境模拟国家重点实验室, 北京 100875,北京师范大学环境学院, 水环境模拟国家重点实验室, 北京 100875,北京师范大学环境学院, 水环境模拟国家重点实验室, 北京 100875,北京师范大学环境学院, 水环境模拟国家重点实验室, 北京 100875

关键词:eDNA宏条形码,白洋淀,微型生物群落,生物监测,

基金:国家自然科学基金项目(52070020);水体污染控制与治理科技重大专项(2018ZX07110001)

传统形态学监测无法识别绝大多数微型生物,环境DNA(eDNA)宏条形码技术提供了一种新型高效的生物监测手段。以白洋淀为例,采用eDNA宏条形码测序技术,开展白洋淀微型生物群落监测,揭示了白洋淀微型生物群落组成、序列数、多样性等的时空分布,比较了eDNA技术和传统形态学方法对藻类的检出能力,分析了eDNA技术的灵敏度和还原力。结果表明:eDNA宏条形码技术检出白洋淀7个微型生物类群的4 569个OTU,分属于567个种,其中细菌(除蓝藻门)最多,原生动物次之,古细菌最少;时间上,白洋淀主要微型生物类群秋季生物多样性最高,夏季次之,微型生物类群的序列数、门与属水平的相对丰度也呈现出明显的季节特征。空间上,优势门类在各采样点的分布大致相似,Epsilonbacteraeota等部分相对丰度较少的门类分布明显不均衡;时间和空间变化均影响白洋淀微型生物群落的组成和分布,季节变化的影响更显著;eDNA比传统形态学方法具有更高的检出能力,二者联合使用更有利于全面获取微型生物组成信息。研究全面揭示了白洋淀微型生物群落信息,探索了eDNA宏条形码技术在北方湿地的应用,印证了该技术的高效性和灵敏度。

来源:2021年第8期

《农业环境科学学报》期刊编辑部

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