农业环境科学学报

作者：陈倩倩,刘波,朱育菁,刘国红,车建美,王阶平,郑雪芳,张海峰

单位：福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003,福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003,福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003,福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003,福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003,福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003,福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003,福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003

关键词：微生物发酵床,细菌多样性,高通量测序,不同深度,

基金：国家重点研发计划项目（2018YFD0500201）；福建省公益类科研院所专项（2018R1017-1）；福建省自然基金项目（2018J01036）；福建省农业科学院农业生物基因组项目（A2017-4）；福建省农业科学院科技创新团队项目（STIT2017-1-11）

为了解微生物发酵床不同深度垫料细菌的多样性，明确不同深度的细菌群落组成，采用五点采样法，收集了发酵床表层10 cm、中层30 cm、深层50 cm的垫料，分别进行垫料宏基因组DNA的提取，原核生物16S rDNA基因V3~V4区的扩增及Illumina高通量测序。试验共获得1 045 225条序列，共包含32门、303科、609属和1834类OTUs。表层垫料细菌数量最多，中层垫料细菌种类最多。微生物发酵床不同深度垫料的细菌群落有所差异，在表层垫料中，变形菌门（25.9%）和放线菌门（10.2%）相对含量高；中层垫料中拟杆菌门（27.8%）、变形菌门（25.1%）和厚壁菌门（17.0%）相对含量高。发酵床垫料表层和中层细菌多为有机物降解菌，主要为异常球菌——栖热菌门的特吕珀菌科、变形菌门的黄单胞菌科和拟杆菌门的黄杆菌科细菌。随着垫料深度增加，拟杆菌门（33.3%）和螺旋体门（9.2%）含量升高，厌氧菌如螺旋体门的螺旋体科、拟杆菌门的腐螺旋菌科在深层垫料中达到峰值。研究表明，表层垫料中微生物含量最高，代谢最为活跃，是主要的有机质降解层；深层垫料厌氧菌含量高。

来源：2019年第10期

《农业环境科学学报》期刊编辑部

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